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来源： 江西yh533388银河（民众号）
2022年4月，T2T联盟（国际科学团队端粒到端粒联盟）宣布了首个完整的人类基因组。这一成绩是通过实验和盘算上的一系列立异实现的，而长读长测序正是卖力生成T2T数据的主要技术。因此，长读长测序技术被《Nature Methods》杂志评为2022年最佳科学要领，正资助全球科学家从人类及其他物种的基因组、转录组和表观基因组中获得大宗发明。无论是PacBio照旧Nanopore技术，在测序前，样本的浓度和纯度丈量均可由NanoPhotometer?完成，结合完整性数据，以确保样实质量切合测序要求。
坐标：意大利锡耶纳大学 分子微生物学与生物技术实验室
期刊：《Microbial Genomics》
测序要领：Oxford Nanopore
牛津纳米孔技术是细菌基因组学的重要工具，使实现长读长测序可能�；褐⒘辞蚓且恢指锢际涎粜韵妇�，属于口腔共生微生物群。有时可能是熏染性心内膜炎、菌血症和败血症等疾病的病因�；褐⒘辞蚓蜃榈闹馗葱云苹盗私鲆揽慷滩庑蚨潦耐暾蜃榈淖樽�。牛津纳米孔测序被证明通过爆发长读长信息来克服这一限制，从而能够解析基因组重复区域并组装完整的基因组序列。由于纳米孔测序运行的输出受到基因组DNA质量和分子量的强烈影响，因此DNA疏散是优化测序运行的要害办法。
研究小组宣布了三种DNA疏散要领的比较结果，这三种要领对高度重组的缓症链球菌基因组的测序进行了验证，旨在从样本中疏散出纯高分子量DNA，作为牛津纳米孔测序实验的模板。研究结果标明，使用基于机械裂解的要领疏散的DNA，尽管本钱更低、速度更快，但不会爆发超长读�。ù蠖寥〕ざ任�59516个碱基），也不允许组装圆形完整基因组。使用两种基于酶解的要领疏散的DNA爆发超长读取，高达181199个碱基，实现了循环完整基因组组装。这些要领可容易地应用于从难裂解的革兰氏阳性细菌中疏散高分子量基因组DNA。
NanoPhotometer?应用：基因组DNA纯度比值丈量。
坐标：美国明尼苏达大学 动物科学系
期刊：《Nucleic Acids Research》
测序要领：Oxford Nanopore
接下来是克里斯托弗·福尔克（Christopher Faulk）在NAR上宣布的突破性文章，论述了长读测序的时间和本钱节约潜力。通常，参考动物基因组生成是一项耗时且本钱高昂的操作。使用纳米孔技术的DNA测序提供了直接、实时、长读取、可扩展、便携式、自动化、快速和全面的基因组剖析。
Faulk仅在一周内就花费1000美元就对这一玄色木匠蚂蚁的基因组进行了测序。与核基因组一起，线粒体基因组与线粒体基因组以及生活在蚂蚁体内的两种共生细菌一起组装。纳米孔技术还使同一只蚂蚁的表观遗传学丈量成为可能，并复制了其他显示DNA甲基化水平很低的研究。参考基因组在连续性和卵白质预测准确性方面优于其他蚂蚁物种。这种要领将允许其他基础型实验室以低本钱创立高质量的基因组组件。
NanoPhotometer?应用：基因组DNA纯度比值丈量。
坐标：印尼布拉干萨理工大学 农学和园艺系
期刊：《Data in Brief》
测序要领：PicBio
野肉豆蔻（Myristica fatua）是印度尼西亚的一种重要香料，研究人员正在对该物种的基因组资源进行剖析，宣布了 Myristica fatua编码序列（CDS），作为第一个转录组参考，该序列利用牛津纳米孔技术的长读测序获得了全长转录组组件。从这些数据中可以获得全长转录本，这有助于研究基因表达剖析。该信息为与肉豆蔻属相关属的作物育种计划提供了EST微卫星分子标记数据集，并可用于鉴定与类黄酮生物合成相关的全长转录物，供分子生物学家在肉豆蔻属和相关属的下游剖析中使用。
NanoPhotometer?应用：肉豆蔻叶中提取的RNA的定量和纯度剖析。
坐标：波多黎各大学马亚圭斯分校 生物学系
期刊：《Genes》
测序要领：PicBio
大安的列斯群岛的亚马逊鹦鹉，代表了岛屿上物种形成的一个模型，类似于加拉帕戈斯群岛的达尔文雀。亚马逊鹦鹉从中美洲大陆迁徙大安的列斯群岛，但关于这种情况爆发的方法和时间没有告竣共识。多国组成的研究小组宣布了一项研究，该研究对大安的列斯群岛所有现存亚马逊鹦鹉物种（a.leucocephala、a.agilis、a.claria、a.ventralis和a.vittata）进行了长读长测序，并注释了完整的线粒体基因组，包括注释的线粒体基因组图，种群多样性和进化历史。
这项研究的数据支持踏脚石扩散（stepping-stone dispersal）和物种形成假说，该假说描述了祖先种群从中美洲大陆抵达时，约莫开始于3.47 MYA（百万年前），并导致了整个安的列斯群岛物种的多样化，抵达波多黎各岛在0.67 MYA。这一剖析有助于理解进化历史，和对序列变革进行后续评估，并有助于设计未来的�；な虑�。
NanoPhotometer?应用：提取的基因组DNA浓度丈量。
如果您使用基因测序作为研究手段，可凭据通量需求选择多种型号的NanoPhotometer?作为对少量或大宗样实质控的工具。相信Implen能够成为您在基因测序事情中值得信赖的好帮手。哪里有测序，哪里就有Implen。
涉及的研究论文地点：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8942023/
https://doi.org/10.1093/nar/gkac510
https://doi.org/10.1016/j.dib.2022.108838
https://doi.org/10.3390/genes12040608
